Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RHOP08100 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RHOP08100 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RHOP08100 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RHOP08100 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOP08100 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOP08100 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOP08100 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOP08100 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOP08100 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOP08100 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RHOP08100 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms