Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4FO95754 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms