Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SIX6O95475 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SIX6O95475 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SIX6O95475 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX6O95475 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms