Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP9O75884 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP9O75884 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms