Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms