Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms