Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms