Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAB2O43741 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAB2O43741 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms