Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms