Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC27A2O14975 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A2O14975 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms