Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E9PBE3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E9PBE3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E9PBE3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
E9PBE3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms