Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms