Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ODF3BA8MYP8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ODF3BA8MYP8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms