Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TTLL13PA6NNM8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms