Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERINC4A6NH21 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC4A6NH21 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC4A6NH21 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC4A6NH21 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC4A6NH21 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC4A6NH21 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC4A6NH21 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC4A6NH21 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC4A6NH21 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC4A6NH21 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC4A6NH21 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC4A6NH21 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC4A6NH21 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERINC4A6NH21 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms