Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C5orf51A6NDU8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms