Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC78A2IDD5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC78A2IDD5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms