Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MAP3K4Q9Y6R4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MAP3K4Q9Y6R4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms