Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SNX13Q9Y5W8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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SNX13Q9Y5W8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SNX13Q9Y5W8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX13Q9Y5W8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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