Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms