Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNPO3Q9Y5L0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms