Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POMPQ9Y244 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POMPQ9Y244 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms