Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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