Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IGSF9BQ9UPX0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms