Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX6Q9UNH7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX6Q9UNH7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms