Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRID1Q9ULK0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms