Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP21Q9UK80 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP21Q9UK80 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms