Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPUSD1Q9UJJ7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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