Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NDUFA12Q9UI09 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms