Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MBD2Q9UBB5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MBD2Q9UBB5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MBD2Q9UBB5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD2Q9UBB5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms