Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COMMD8Q9NX08 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms