Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms