Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8A2Q9NTI2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8A2Q9NTI2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms