Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHARPINQ9H0F6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms