Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms