Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms