Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM55Q9BYV6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms