Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIFKQ9BYG3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms