Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms