Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms