Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEP89Q96ST8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP89Q96ST8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms