Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPS6KC1Q96S38 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms