Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMG1Q96Q15 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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