Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PRIMPOLQ96LW4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms