Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPNS2Q96L46 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPNS2Q96L46 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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