Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
PRAC1Q96KF2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms