Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71F1Q96KD3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms