Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEIL1Q96FI4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEIL1Q96FI4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms