Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MALSU1Q96EH3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms