Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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FAM3DQ96BQ1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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